Joonis 12. Joon. 8 toodud eukarüootide fülogenees mugandatud vastavalt Arisue et al. (2005) saadud tulemustele. (A) Fülogenees, mis saadi ~20 geeni analüüsil, eeldusel et Excavata on monofüleetiline; selline fülogenees vastab Stechmann & Cavalier-Smith (2002) omale (Unikonta on parafüleetiline). (B) Fülogenees, mis saadi samade geenide ja meetoditega, kuid ilma mainitud piiranguta. Arisue et al. (2005) arvavad, et Parabasala ja Diplomonadida selline positsioon (joonis B) võib antud juhul olla LBA (long-branch attraction) artefakt ning seetõttu on kõige primitiivsemateks eukarüootideks tõenäoliselt ikkagi tagaviburilised (Opisthokonta) (joonis A). Tärniga (*) tähistatud taksonid paigutatakse Excavata hulka (Simpson, 2003; Cavalier-Smith, 2003).